Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RHBDD3Q9Y3P4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RHBDD3Q9Y3P4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms