Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC4Q9Y296 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC4Q9Y296 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms