Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RNF6Q9Y252 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF6Q9Y252 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms