Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TTF2Q9UNY4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms