Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS3Q9UNS2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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