Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD4Q9ULV1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FZD4Q9ULV1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms