Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FBXL4Q9UKA2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FBXL4Q9UKA2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms