Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RIMS3Q9UJD0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms