Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPC1L1Q9UHC9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms