Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DKK2Q9UBU2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms