Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLKQ9UBT6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms