Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCMF1Q9P0J7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms