Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT57Q9NWB7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT57Q9NWB7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms