Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNF275Q9NSD4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms