Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX15Q9NRS6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX15Q9NRS6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms