Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IL1RAPQ9NPH3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms