Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRA1Q9HD15 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms