Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCL11BQ9C0K0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCL11BQ9C0K0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms