Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LNPKQ9C0E8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LNPKQ9C0E8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LNPKQ9C0E8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LNPKQ9C0E8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LNPKQ9C0E8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms