Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KATNB1Q9BVA0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms