Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MCMBPQ9BTE3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms