Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms