Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF559Q9BR84 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms