Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
RETNLBQ9BQ08 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms