Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARAP1Q96P48 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARAP1Q96P48 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms