Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC114Q96M63 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms