Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD8Q96LT4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms