Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COG3Q96JB2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms