Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM12Q96EX1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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