Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ELP4Q96EB1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms