Protein–RNA interactions for Protein: Q96DI7

SNRNP40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP40Q96DI7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRNP40Q96DI7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms