Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KCTD12Q96CX2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KCTD12Q96CX2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms