Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSLPQ969D9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSLPQ969D9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms