Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CNOT9Q92600 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CNOT9Q92600 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms