Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF3Q92576 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms