Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN4Q92575 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBXN4Q92575 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms