Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRHL3Q8TE85 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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