Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAAF3Q8N9W5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAAF3Q8N9W5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms