Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGSF1Q8N6C5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms