Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC117Q8IWD4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC117Q8IWD4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms