Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ3

CD300LD, CMRF35-like molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LDQ6UXZ3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD300LDQ6UXZ3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms