Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZCCHC12Q6PEW1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms