Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms