Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SAPCD1Q5SSQ6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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