Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNFT1Q5M7Z0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms