Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITRM1Q5JRX3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITRM1Q5JRX3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms