Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRRC23Q53EV4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC23Q53EV4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms