Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP28Q4G0W2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms