Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC14Q49A88 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC14Q49A88 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms