Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTLL9Q3SXZ7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms